El microscopio confocal es un microscopio que emplea una técnica óptica de imagen para incrementar el contraste y/o reconstruir imágenes tridimensionales utilizando un "pinhole" espacial para eliminar la luz desenfocada o destellos de la lente en especímenes que son más gruesos que el plano focal. El pinhole es una apertura localizada delante del fotomultiplicador que evita el pasaje de.. Un microscopio confocal es un tipo particular de microscopio fluorescente que se utiliza para obtener imágenes 2D y 3D de alta calidad. Con un microscopio fluorescente básico (de campo amplio), se ilumina una muestra con luz de una longitud de onda particular, y la muestra absorbe parte de esa luz y refleja el resto a una longitud de onda más larga.

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